|
|
| 名称 BandLeader |
时间 |
| 版本 3.00 |
操作平台 Windows95/98 |
功能简介 BandLeader提供了各种工具用以处理DNA或Protein凝较电泳图谱中的各项数据.本软件主要面向用
户为从事基因组及分子生物学研究的人员.BandLeader可以使用户对未经加工的电泳图谱进行分析,进而得出各种数据并可将其存储到磁盘上以便进一步的研究和分析.
BandLeader工作步骤如下：
1.Displaying the image on the computer screen;
2.Processing the image to enhance significant data;
3.Analyzing the image through the extraction of image intensities in chosen areas
and their presentation on graphs or on lists;
4.Processing acquired graphs to enhance significant data;
5.Saving extracted information on disk file for further analysis or incorporation
into other projects. |
| 名称 DNAfrag |
时间 December 1991 |
| 版本 3.03 |
操作平台 DOS |
| 功能简介 本程序用于绘制DNA限制性图谱并可根据琼脂糖或 SDS-PAGE凝胶电泳结果测量蛋白质或多肽的长度.它可以计算出DNA限制性片断的长度.如果存在标准带，它也可计算凝胶上的蛋白质或多肽条带长度.
DNAfrag可根据LSFDFLGM法则 ("Least squares fit of DNA fragment length
to gel mobility" algorithm of Schaffer, H.E. and Sederoff, R.R.(1981),Analytical
Biochemistry vol 115, pp 113-122.)绘出DNA或蛋白质标准条带迁移率(由用户自己测量)的标准曲线.
|
| 名称 Dnasize |
时间 |
| 版本 1.0 |
操作平台 DOS |
| 功能简介 DNASIZE用于从琼脂糖或SDS-PAGE电泳凝胶中提取数据，测算DNA片段或蛋白质/多肽的大小.它还可以根据标准数据(如已知大小的对照物的迁移率),利用图形化方法(该方法整合了线性衰退方法linear
regression method及双曲线衰退方法hyperbolic regression method)计算标准曲线. |
| 名称 ElBaMaP |
时间 |
| 版本 2.2 |
操作平台 DOS |
| 功能简介 ElBaMaP(电泳条带管理软件包Electrophoresis Band Management
Package) 由16个有关数据入口,计算,对比基图形显示 (data-entry, calculation, comparison
and graphic representation)的进程(procedures)组成. 用户在选择主菜单上的选项后，这些进程会在内部自动选择响应.数据库文件可以存储下来以便进做一步分析或增添数据.
电泳条带图形对比可以存储在一个类似矩阵(similarity matrix)中以便其他程序包用来做多重分析(multivariate
or cluster analysis).考虑到一些PC的内存，本软件一次可以从数据库中读入200条记录. |
| 名称 GEL－JML |
时间 May 4 1992 |
| 版本 1.1 beta |
操作平台 DOS |
功能简介 GEL－JML 用来计算琼脂糖凝胶上的DNA片段长度. 在本程序中, 你可以输入DNA凝胶电泳结果(the
results of a DNA gel)及标准标记(standards),每个文件可以输入进去20个well,每个well最多可以有20条bands(以.gel为扩展名的文件).凝胶中至少要有一个标准DNA,每个胶中最多可以有三个不同的标准标记，GEL会选择最接近的标准来计算DNA片段长度.
DNA片段长度的计算可见于以下两个文献：
- Measurement of DNA Length by Gel Electrophoresis. E.M. Southern.
1979. Anal. Biochem. 100:319-323.
- Improved Estimation of DNA Fragment Lengths from Agarose Gels.
H.E. Schaffer and R.R. Sederoff. 1981. Anal. Biochem. 115:113-122.
|
| 名称 Typeseq、Digiseq、Bigmouth |
时间 |
| 版本 |
操作平台 |
功能简介 Typeseq或Digiseq允许用键盘或Graf/Bar7方式(其是一种数字化探测装置，可以探测DNA序列凝胶中的条带)快速输入序列DNA序列数据条目,并计算残基数.
Typeseq或Digiseq支持的序列格式包括：
UWGCG (Wisconsin programs)
R. Staden
D. Mount
DNA*Star
IntelliGenetics
|
|
