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我如何根据类型来筛选特征？
如果你解析一个详细的GenBank文件，你将会面对包含不同类型的多个特征的序列。也许你仅仅对其中一些类型的特征感兴趣，比如说"CDS"。
你应该使用特征过滤器(FeatureFilter)来过滤这些特征，特征过滤器能产生一个特征拥有者(FeatureHolder)对象来存储你感兴趣的特征。
下面的例子展示了如何用类型来筛选特征。
import java.util.*;
import org.biojava.bio.seq.*;
public class FilterByType {
public static void main(String[] args){
Sequence seq = null;
//
// 在这里编写初始化序列的代码，你可以读取象GenBank或者相似的文件生成带有多个不同特征的序列。
//
// 创建一个依据"CDS"类型的过滤器
FeatureFilter ff = new FeatureFilter.ByType("CDS");
// 获得筛选的特征
FeatureHolder fh = seq.filter(ff)
// 遍历特征拥有者(fh)所有的特征
for (Iterator i = fh.features(); i.hasNext(); ){
Feature f = (Feature)i.next();
}
}
}
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